<div dir="ltr"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif">When:    Tuesday<span class="gmail-m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-m_-4938037190879263006gmail-m_3362974898759286267gmail-m_8638631580643762924gmail-m_-7002887145228343606gmail-m_-1824866688285446566gmail-aBn">, August 29th at 10:00 am</span><br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Where:   TTIC, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526<br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Who:      Somaye Hashemifar, TTIC</div></div><div><br></div><div><br></div><span style="font-size:12.8px">Title:       Computational Prediction and Analysis of Protein-protein Interaction Networks</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Abstract:<br></span>Biological <span class="gmail-m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide insight into the complex organization of biological processes in a cell at the system level.  They are an effective tool for understanding the comprehensive map of functional interactions, finding the functional  modules and pathways.Reconstruction and comparative analysis of these <span class="gmail-m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide useful information to identify functional modules, prioritization of disease causing genes and also identification of drug targets. The <span class="gmail-m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">talk</span> will consist of two parts. I will discuss several methods for protein-protein interaction network alignment and investigate their preferences to other existing methods. Further, <span style="font-size:12.8px">I briefly </span><span style="font-size:12.8px">talk about reconstruction of protein-protein interaction</span><span style="font-size:12.8px"> </span><span class="gmail-m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il" style="font-size:12.8px">networks by using deep learning</span><span style="font-size:12.8px">. </span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"></div></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Thesis Advisor: Jinbo Xu</span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:(773) 834-1757</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: (773) 357-6970</font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Mon, Aug 28, 2017 at 12:28 PM, Mary Marre <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank">mmarre@ttic.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif">When:    Tuesday<span class="m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-m_-4938037190879263006gmail-m_3362974898759286267gmail-m_8638631580643762924gmail-m_-7002887145228343606gmail-m_-1824866688285446566gmail-aBn">, August 29th at 10:00 am</span><br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Where:   TTIC, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526<br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Who:      Somaye Hashemifar, TTIC</div></div><div><br></div><div><br></div><span style="font-size:12.8px">Title:       Computational Prediction and Analysis of Protein-protein Interaction Networks</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Abstract:<br></span>Biological <span class="m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide insight into the complex organization of biological processes in a cell at the system level.  They are an effective tool for understanding the comprehensive map of functional interactions, finding the functional  modules and pathways.Reconstruction and comparative analysis of these <span class="m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide useful information to identify functional modules, prioritization of disease causing genes and also identification of drug targets. The <span class="m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">talk</span> will consist of two parts. I will discuss several methods for protein-protein interaction network alignment and investigate their preferences to other existing methods. Further, <span style="font-size:12.8px">I briefly </span><span style="font-size:12.8px">talk about reconstruction of protein-protein interaction</span><span style="font-size:12.8px"> </span><span class="m_6109703197609053014gmail-m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il" style="font-size:12.8px">networks by using deep learning</span><span style="font-size:12.8px">. </span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"></div></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Thesis Advisor: Jinbo Xu</span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_6109703197609053014gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:<a href="tel:(773)%20834-1757" value="+17738341757" target="_blank">(773) 834-1757</a></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: <a href="tel:(773)%20357-6970" value="+17733576970" target="_blank">(773) 357-6970</a></font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 23, 2017 at 2:39 PM, Mary Marre <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank">mmarre@ttic.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif">When:    Tuesday<span class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-m_-4938037190879263006gmail-m_3362974898759286267gmail-m_8638631580643762924gmail-m_-7002887145228343606gmail-m_-1824866688285446566gmail-aBn">, August 29th at 10:00 am</span><br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Where:   TTIC, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526<br></div><div style="font-size:12.8px;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>Who:      Somaye Hashemifar, TTIC</div></div><div><br></div><div><br></div><span style="font-size:12.8px">Title:       Computational Prediction and Analysis of Protein-protein Interaction Networks</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Abstract:<br></span>Biological <span class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide insight into the complex organization of biological processes in a cell at the system level.  They are an effective tool for understanding the comprehensive map of functional interactions, finding the functional  modules and pathways.Reconstruction and comparative analysis of these <span class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">networks</span> provide useful information to identify functional modules, prioritization of disease causing genes and also identification of drug targets. The <span class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il">talk</span> will consist of two parts. I will discuss several methods for protein-protein interaction network alignment and investigate their preferences to other existing methods. Further, <span style="font-size:12.8px">I briefly </span><span style="font-size:12.8px">talk about reconstruction of protein-protein interaction</span><span style="font-size:12.8px"> </span><span class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail-m_-3214058522717337993gmail-il" style="font-size:12.8px">networks by using deep learning</span><span style="font-size:12.8px">. </span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"></div></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Thesis Advisor: Jinbo Xu</span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div></div><div><div class="m_6109703197609053014m_-8979619715167314091gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:<a href="tel:(773)%20834-1757" value="+17738341757" target="_blank">(773) 834-1757</a></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: <a href="tel:(773)%20357-6970" value="+17733576970" target="_blank">(773) 357-6970</a></font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>
</blockquote></div><br></div></div>
</blockquote></div><br></div></div>