<div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px"><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">When:     Wednesday, February 22nd at 11:00 am </font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">Where:    <span class="gmail-m_9110287542703836342gmail-m_-1375962450881303908gmail-m_-9002782852122119536gmail-m_4588640196162890717m_3136881027827703783gmail-m_-5845083723734738781gmail-m_8936094986121047744gmail-m_-3164973227124251497gmail-m_2953668934074478317gmail-m_-3155518689668024534m_9067904842688472155gmail-m_3071693547520408192gmail-il">TTIC</span>, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526</font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><font color="#000000">Who:       </font></span></font><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><span class="gmail-m_9110287542703836342gmail-il">Shahin</span> Mohammadi, Purdue</font></div></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Title:     <span style="font-size:12.8px">Take ACTION to Characterize the Functional Identity of Single Cells</span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Abstract:</div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Single-cell transcriptomic data has the potential to radically redefine our view of cell type identity. Cells that were previously believed to be homogeneous are now clearly distinguishable in terms of their expression phenotype. Methods for automatically characterizing the functional identity of cells, and their associated properties, can be used to uncover processes involved in lineage differentiation as well as sub-typing cancer cells. They can also be used to suggest personalized therapies based on molecular signatures associated with pathology. </span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">In this talk, I will introduce a method that I have recently developed, called Archetypal-analysis for cell type identificaTION (ACTION), to infer the functional identity of cells from their transcriptional profile, classify them based on their principal functions, and reconstruct regulatory networks that are responsible for mediating their identity. Results from using ACTION to sub-type cancer cells in Melanoma patients reveal novel biomarkers along with their underlying regulatory networks.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Host: <a href="mailto:jinbo.xu@gmail.com" target="_blank">Jinbo Xu</a></div><div style="font-size:12.8px"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:(773) 834-1757</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: (773) 357-6970</font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Feb 21, 2017 at 2:34 PM, Mary Marre <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank">mmarre@ttic.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px"><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">When:     Wednesday, February 22nd at 11:00 am </font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">Where:    <span class="m_9110287542703836342gmail-m_-1375962450881303908gmail-m_-9002782852122119536gmail-m_4588640196162890717m_3136881027827703783gmail-m_-5845083723734738781gmail-m_8936094986121047744gmail-m_-3164973227124251497gmail-m_2953668934074478317gmail-m_-3155518689668024534m_9067904842688472155gmail-m_3071693547520408192gmail-il">TTIC</span>, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526</font></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><font color="#000000">Who:       </font></span></font><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><span class="m_9110287542703836342gmail-il">Shahin</span> Mohammadi, Purdue</font></div></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Title:     <span style="font-size:12.8px">Take ACTION to Characterize the Functional Identity of Single Cells</span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Abstract:</div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Single-cell transcriptomic data has the potential to radically redefine our view of cell type identity. Cells that were previously believed to be homogeneous are now clearly distinguishable in terms of their expression phenotype. Methods for automatically characterizing the functional identity of cells, and their associated properties, can be used to uncover processes involved in lineage differentiation as well as sub-typing cancer cells. They can also be used to suggest personalized therapies based on molecular signatures associated with pathology. </span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">In this talk, I will introduce a method that I have recently developed, called Archetypal-analysis for cell type identificaTION (ACTION), to infer the functional identity of cells from their transcriptional profile, classify them based on their principal functions, and reconstruct regulatory networks that are responsible for mediating their identity. Results from using ACTION to sub-type cancer cells in Melanoma patients reveal novel biomarkers along with their underlying regulatory networks.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Host: <a href="mailto:jinbo.xu@gmail.com" target="_blank">Jinbo Xu</a></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_9110287542703836342gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:<a href="tel:(773)%20834-1757" value="+17738341757" target="_blank">(773) 834-1757</a></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: <a href="tel:(773)%20357-6970" value="+17733576970" target="_blank">(773) 357-6970</a></font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Feb 15, 2017 at 7:16 PM, Mary Marre <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank">mmarre@ttic.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">When:     Wednesday, February 22nd at 11:00 am </font></div><div style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">Where:    <span class="m_9110287542703836342m_-1375962450881303908gmail-m_-9002782852122119536gmail-m_4588640196162890717m_3136881027827703783gmail-m_-5845083723734738781gmail-m_8936094986121047744gmail-m_-3164973227124251497gmail-m_2953668934074478317gmail-m_-3155518689668024534m_9067904842688472155gmail-m_3071693547520408192gmail-il">TTIC</span>, 6045 S Kenwood Avenue, 5th Floor, Room 526</font></div><div style="font-size:12.8px"><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><font color="#000000">Who:       </font></span></font><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><span style="font-size:12.8px">Shahin Mohammadi, Purdue</span></font></div></div><div><br></div><div><br></div><div style="font-size:12.8px">Title:     <span style="font-size:12.8px">Take ACTION to Characterize the Functional Identity of Single Cells</span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Abstract:</div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Single-cell transcriptomic data has the potential to radically redefine our view of cell type identity. Cells that were previously believed to be homogeneous are now clearly distinguishable in terms of their expression phenotype. Methods for automatically characterizing the functional identity of cells, and their associated properties, can be used to uncover processes involved in lineage differentiation as well as sub-typing cancer cells. They can also be used to suggest personalized therapies based on molecular signatures associated with pathology. </span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">In this talk, I will introduce a method that I have recently developed, called Archetypal-analysis for cell type identificaTION (ACTION), to infer the functional identity of cells from their transcriptional profile, classify them based on their principal functions, and reconstruct regulatory networks that are responsible for mediating their identity. Results from using ACTION to sub-type cancer cells in Melanoma patients reveal novel biomarkers along with their underlying regulatory networks.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Host: <a href="mailto:jinbo.xu@gmail.com" target="_blank">Jinbo Xu</a></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div><div class="m_9110287542703836342m_-1375962450881303908gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Mary C. Marre</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Administrative Assistant</font></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6"><b>Toyota Technological Institute</b></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">6045 S. Kenwood Avenue</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Room 504</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#3d85c6">Chicago, IL  60637</font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">p:<a href="tel:(773)%20834-1757" value="+17738341757" target="_blank">(773) 834-1757</a></font></i></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">f: <a href="tel:(773)%20357-6970" value="+17733576970" target="_blank">(773) 357-6970</a></font></i></div><div><b><i><a href="mailto:mmarre@ttic.edu" target="_blank"><font face="arial, helvetica, sans-serif">mmarre@ttic.edu</font></a></i></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>
</blockquote></div><br></div></div>
</blockquote></div><br></div>